《表4 下调差异基因GO富集分析》

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《拟南芥子叶与真叶差异基因的生物信息分析》


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GO富集分析的结果显示,差异基因大多富集到CC,即细胞组分当中,其中细胞质部件(Cytoplasmic part)、叶绿体(Chloroplast)、质体(Plastid)、细胞器部件(Organelle part)等差异比较明显(图1)。把上调差异基因和下调差异基因分别做GO富集分析,再按校正后的P值排列,得到排名前十的结果。上调差异基因的GO富集分析,与整体分析结果极为相似(图1),都富集到细胞组分中,按校正后的结果来看,细胞质部件,细胞质,对非生物刺激的反应,细胞部件,细胞器部件,叶绿体,质体,差异都极其显著(表3);下调差异基因的GO富集分析结果表明,差异显著的是叶绿体部件、质体部件,另外还存在一些P值校正后不显著的部分,包括叶绿体、质体、蓝光对阴离子通道活性的调节、蓝光对阴离子通道活性的负调控、吲哚族芥子油苷分解代谢途径、阴离子通道活性的负调节、转运蛋白活性的负调控等(表4)。