《表2 组装结果各指标统计》
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《赤红球菌SD3全基因组测序及其热休克蛋白DnaK的表达分析》
利用G-tubes方法将赤红球菌SD3基因组DNA片段化,补平末端,完成单分子测序建库(Bao et al.,2016)。建库后进行单分子测序,将测序获得的原始数据中的每条Read都经过质量过滤得到单分子测序Clean数据Reads的长度和质量分布统计图(图1)。将质量剪切前后的数据进行测序Reads数、Reads读长、总碱基数的统计(表1)。经过组装(Li et al.,2010)后获得大小约为5.37 Mb的Rhodococcusruber SD3的全基因组完成图。该基因组的GC含量为70.63%,仅含一条Scaffolds(表2),组装的数据已上传至GenBank数据库,登录号为CP029146。
图表编号 | XD00156628700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.04.25 |
作者 | 樊欣、彭仁 |
绘制单位 | 江西师范大学生命科学学院、江西师范大学生命科学学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |