《表2 contig和scaffold组装结果数据统计》

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《三岛柴胡基因组Survey分析及SSR位点挖掘》

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用K-mer=41进行组装到contig和scaffold，统计结果见表2。对组装的contig进行GC含量统计，结果见图2，横坐标表示GC含量，纵坐标表示测序深度，右方是测序深度分布，上方是GC含量分布，其中红色的部分代表该散点图中点的密度比较大的部分。从GC-Depth分布图中能够看出其被分成2层，结合杂合模拟显示三岛柴胡高度杂合的结果，可推测是由杂合引起。经计算预估三岛柴胡基因组GC量为33.66%。