《表2 7个水稻样品的基因组组装结果统计a)》
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《基因组学方法用于水稻种质资源实质派生的检测结果和应用讨论》
a):N50:Reads拼接后会获得一些不同长度的Contigs.将所有的Contig长度相加,能获得一个Contig总长度.然后将所有的Contig按照从长到短进行排序,当相加的长度达到Contig总长度的50%时,最后一个加上的Contig长度即为Contig N50.N90:Reads拼接后会获得一些不同长度的Contigs.将所有
7个水稻的组装结果如表2,最终获得的基因组总长在343.4~395.2 Mb之间.其中ZHS,ANS-1,SH08S,NK58品种基因组Contig N50为8.1~8.9 kb,增加了10K文库的Y58S,PA64S和NK58S三个品种基因组的contig N50在34.9~40.0 kb.
图表编号 | XD00162074300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.06.20 |
作者 | 张上都、袁定阳、路洪凤、简燕、李秀欣、黄安平、罗正良、吕启明、谭炎宁、张勇飞、袁隆平、柏连阳 |
绘制单位 | 湖南省农业科学院、中南大学研究生院隆平分院、贵州省农业科学院水稻研究所、湖南省农业科学院、北京诺禾致源科技股份有限公司、湖南省农业科学院、北京诺禾致源科技股份有限公司、湖南省农业科学院、湖南省农业科学院、湖南省农业科学院、湖南省农业科学院、湖南省农业科学院、湖南省农业科学院、湖南省农业科学院、中南大学研究生院隆平分院 |
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