《表4 7个样品使用珍汕97作为参考基因组的IS相似性评估结果》

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《基因组学方法用于水稻种质资源实质派生的检测结果和应用讨论》

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用IS方法比较7个作物材料的基因组相似度尚未见报道.IS分析是针对动物群体遗传学研究开发的方法，是根据个体基因型差异计算两两个体间的基因序列一致性，进而体现群体间基因序列相似度的一种分析方法[14].在对7个品种进行较为粗犷的热图比较时，本团队发现，农垦58和农垦58S存在很高的相似度，因为农垦58S是石明松先生利用农垦58这个从日本引进品种的田间自然突变株作为回交父本，于1973年在单季晚稻成熟时，根据不育株结粒少、不低头、老来青等特点，在晚粳稻农垦58的大田中选择3株自然不育株，次年种成的株行.其中有1个株行形态上与农垦58十分相似，整齐一致.从1974年开始，在分离出来的可育株中选择单株形成选系，作为连续回交的父本使用.1976～1979年间共回交了4次[20].本研究获得的农垦58的种子则不知道是经历了多少年的扩繁，具体的扩繁次数已经无法确定.更令人吃惊的是，准S和安农S-1之间有着比自然突变的农垦58S和变异材料更高的相似度（表4）.结果表明，ZHS和ANS-1之间的SNP相似度达到了99.74%，而已知的派生品种NK58S与出发品种之间的相似度是96.23%.据此可判断，ZHS晚于ANS-1多年才被育成，因而ZHS是ANS-1的派生品种.具体的阈值判断，在本文的讨论部分展开.