《表2 7个甘蔗查尔酮合成酶家族基因编码蛋白的氨基酸序列相似性》

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《甘蔗查尔酮合成酶基因的挖掘、序列分析及表达分析》

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基于课题组构建的甘蔗应答黑穗病菌侵染（Que et al.，2014）和低氮胁迫（Yang et al.，2019）的转录组注释库，挖掘获得7个具有完整开放阅读框（open reading frame，ORF）的甘蔗Sc CHS基因Unigene序列，分别命名为Sc CHS1～Sc CHS7。利用生物信息学软件分析Sc CHSs蛋白的氨基酸序列特征（表1），结果显示，7个Sc CHS家族基因编码蛋白的氨基酸数介于390～407，蛋白相对分子量在41.98～43.51 k D之间，编码区G+C含量介于48.38%～68.16%；除Sc CHS5蛋白的等电点大于7外，其余6个Sc CHS蛋白的等电点均为酸性；Sc CHS1和Sc CHS7蛋白的不稳定系数小于40，而Sc CHS2～Sc CHS6蛋白的不稳定系数均大于40；除Sc CHS1蛋白的脂肪指数小于90.00%外，其余6个Sc CHS蛋白的脂肪指数均大于90.00%；Sc CHS1～Sc CHS7蛋白均无分泌信号肽和跨膜区。Sc CHS1～Sc CHS7之间的氨基酸序列相似性差异较大，介于12.47%～87.22%（表2），其中，Sc CHS5与其余6个Sc CHS的氨基酸序列一致性较低。对7个Sc CHS基因编码蛋白的氨基酸序列进行多重比对（图1），结果显示Sc CHS1～Sc CHS7均含有c （Cys）、f（Phe）、h （His）和n （Asn）这4个构成CHS蛋白催化中心的保守残基。由上述结果推测，Sc CHS1～Sc CHS7蛋白均为非分泌CHS蛋白，Sc CHS1和Sc CHS7为酸性稳定蛋白，Sc CHS2、Sc CHS3、Sc CHS4和Sc CHS6为酸性不稳定蛋白，Sc CHS5蛋白为碱性不稳定蛋白。