《表2 TCS1g与TCS1其他6个等位变异编码区核酸序列 (矩阵的上半部分) 和蛋白序列 (矩阵的下半部分) 的相似性 (%) 比较》

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《茶树咖啡碱合成酶基因稀有等位变异TCS1g的筛选、克隆及功能》

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TCS1g与TCS1a—TCS1f的核酸序列相似度在94.1%—99.2%，与TCS1a—TCS1f的蛋白序列的相似度均大于90%，其中与具有TS活性的TCS1b、TCS1c相似度都大于96%（表2）。TCS1g与咖啡中现已克隆（NCBI登陆）的NMTs编码区序列的相似性在29.3%—39.8%，与可可中分离的具有可可碱合成酶功能的BCS1（AB096699）[15]的序列相似度为55.0%。利用茶树、可可和咖啡中NMT的cDNA序列进行系统发生树分析（图3），发现不同物种的NMT独立成簇，茶树中TCS1的不同等位变异聚为两类，Ⅰ类包括新克隆的TCS1g和表达蛋白仅具有可可碱合成酶活性的TCS1b、TCS1c，Ⅱ类包括TCS1a、TCS1d、TCS1e、TCS1f。