《表2 草地贪夜蛾自噬相关蛋白的序列与相似性分析》
1)“*”表示获得该基因的部分序列;2)早期在酵母中鉴定的参与自噬的基因被称为Apg,后来统一使用Atg来命名
根据已经报道的昆虫和哺乳动物等多个物种中的ATG序列,在草地贪夜蛾网站(https://bipaa.genouest.org/sp/spodoptera_frugiperda_pub/blast/)进行同源序列的比对分析,获得了10多个核心自噬相关基因,其中包括已经报道的Atg8(NCBI登录号MF069154.1),和Atg3、Atg5、Atg6、Atg7、Atg10、Atg12、Atg13和Atg101基因序列的全长,以及Atg1、Atg2、Atg4、Atg9、Atg14、Atg16、Atg17和Atg18等基因的部分序列(表2)。利用smart blast在线比对工具,比较获得的草地贪夜蛾ATG蛋白和黑腹果蝇、人类ATG蛋白的氨基酸序列相似性,显示草地贪夜蛾基因组中存在高度保守的ATG序列。从表2的比对结果可见,具有完整序列的ATG蛋白中,ATG8的保守性最高,草地贪夜蛾ATG8与黑腹果蝇ATG8、人类GABARAP的氨基酸序列相似性分别为93.10%和90.52%;ATG3的保守性也很高,与黑腹果蝇ATG8、人类GABARAP的氨基酸序列相似性分别为65.88%和64.40%;ATG5、ATG6、ATG12、ATG101与果蝇序列相似性在50%以上,暗示了草地贪夜蛾自噬相关蛋白具有参与自噬的保守功能。
图表编号 | XD00194587300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2021.01.01 |
作者 | 马秋琴、王禹生、梁宽、韩勇、易辉玉、邓小娟 |
绘制单位 | 华南农业大学动物科学学院、广东省农业动物功能基因组学与分子育种重点实验室、广东省蚕桑工程技术研究中心、华南农业大学动物科学学院、广东省农业动物功能基因组学与分子育种重点实验室、广东省蚕桑工程技术研究中心、华南农业大学动物科学学院、广东省农业动物功能基因组学与分子育种重点实验室、广东省蚕桑工程技术研究中心、华南农业大学动物科学学院、广东省农业动物功能基因组学与分子育种重点实验室、广东省蚕桑工程技术研究中心、华南农业大学动物科学学院、广东省农业动物功能基因组学与分子育种重点实验室、广东省蚕桑工程技术研究中心、 |
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