《表2 PtNRAMP、CjNRAMP和AtNRAMP蛋白序列的相似性》

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《枳和‘资阳香橙’NRAMP家族基因鉴定、克隆及响应营养逆境的表达模式分析》

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为比较枳和‘资阳香橙’NRAMP基因间及与其他植物NRAMP基因间的同源性和进化关系，对PtNRAMPs，CjNRAMPs和拟南芥AtNRAMPs蛋白序列进行了多重比对、进化树构建和结构域分析。结果表明三者之间具有高度的相似性（图1和表2），其中PtNRAMP2/CjNRAMP2与AtNRAMP2（78.9%/78.7%）、PtNRAMP3/CjNRAMP3与AtNRAMP3（79.3%/79.5%）的相似性最高（表2）。PtNRAMP6.1/CjNRAMP6.1以及PtNRAMP6.2/CjNRAMP6.2均与AtNRAMP6序列的相似性最高（表2）。PtNRAMPs和CjNRAMPs之间的比较结果显示，PtNRAMP2和CjNRAMP2在7个氨基酸残基上存在差异，PtN-RAMP3和CjNRAMP3有2个氨基酸残基的差异，PtNRAMP6.2和CjNRAMP6.2有6个氨基酸残基的差异，PtNRAMP6.1和CjNRAMP6.1之间没有差异（图1）。PtNRAMPs与CjNRAMPs蛋白的系统进化树与AtNRAMPs相似，均可分为两大分枝，其中拟南芥AtNRAMP2、AtNRAMP3、AtNRAMP4、AtN-RAMP5与PtNRAMP2、PtNRAMP3、CjNRAMP2和CjNRAMP3在同一分枝，而AtNRAMP1、AtN-RAMP6与PtNRAMP6.1、PtNRAMP6.2、CjN-RAMP6.1和CjNRAMP6.2在另一分枝，相近分枝中的NRAMP蛋白通常具有相似的基因结构和保守结构域（图2）。PtNRAMPs和CjNRAMPs的亚细胞定位预测结果表明PtNRAMP6.1，PtNRAMP6.2，CjN-RAMP6.1和CjNRAMP6.2定位在细胞膜上，PtN-RAMP2，PtNRAMP3，CjNRAMP2和CjNRAMP3定位在液泡中（表1）。