《表3 24株CVA6与参考序列VP1核苷酸和氨基酸序列相似性分析》

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《2019年深圳市坪山区手足口病病原谱及柯萨奇病毒A6型基因特征分析》

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注：序号与样本对应关系同表1。/左侧为核苷酸同源性，/右侧为氨基酸同源性。

使用DNAStar7.01软件中MegAlign对24份CVA6病毒VP1基因序列进行核苷酸和氨基酸同源性分析，结果见表2。数据显示其核苷酸和氨基酸存在一定的差异，分别为93.4%～99.9%和98.4%～100.0%；pingshan201909和pingshan201915的核苷酸和氨基酸同源性为100.0%，可视为同一毒株。与4株同型参考株（KY211721.1、KU736939.1、JQ946050.1和JX154921.2）核苷酸同源性为87.7%～96.8%，氨基酸同源性为97.7%～99.7%。见表3。