《表1 龙岗区2017年26份EV71和EV71各基因亚型代表株VP1区核苷酸和氨基酸序列同源性分析》

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《深圳市龙岗区2017年手足口病病原柯萨奇病毒A16型及肠道病毒71型VP1区基因特征分析》

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获得26份EV71的VP1编码区片段，19份成功上传至Genbank（accession numbers:MH644594～MH644612），用DNASTAR进行同源性比对，VP1区核苷酸（Nucleotide，nt）和氨基酸（Amine acid，aa）序列同源性分别为93.2%～100.0%、96.8%～100.0%。龙岗EV71序列与Genbank中各基因亚型代表株[7]进行同源性比对，发现龙岗区EV71序列与C4a亚型代表株相似性最高，核苷酸同源性为94.6%～96.9%，氨基酸同源性为97.1%～99.4%，见表1。