《表2 J098/YN/CHN/2014毒株与其他基因型参考株VP1区核苷酸、氨基酸同源性分析》

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《云南省2014年1株肠道病毒71型B5亚型病毒全基因组序列分析》

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GenBank上通过该株全基因组检索到的有100条B5亚型EV-A71全基因组序列，本研究中搜索到最早的B5型序列为2000年新加坡株（5511-SIN-2000）。采用MEGA 5.0软件的双参数遗传距离模型（Kimura 2-parameter model，K2-P）对此次研究分离到的J098/YN/CHN/2014毒株与GenBank检索到的国内外其他基因型EV-A71参考株的核苷酸、氨基酸同源性进行分析（表2）。结果显示，该毒株与其他B5基因型参考株的核苷酸及氨基酸的同源性最高，分别为92.4%～98.0%和98.4%～99.4%；与A基因型的同源性最低，分别为76.3%～78.9%和93.8%～96.3%。其中，与2012年越南株（VNM/62/2012）的同源性最高，分别为98.0%和99.4%。