《表1 RABV野毒株与疫苗株N基因核苷酸、氨基酸同源性比较》

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《百色市RABV野毒株与疫苗株N基因同源性比对分析》


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注:右上角为核苷酸同源性数据,左下角为氨基酸同源性数据。

Kissi等[3]提出RABV分型标准,野毒株N基因核苷酸和氨基酸序列同源性为88.9%~99.3%和98.4%~99.1%,为基因I型;1号与2号、3号、4号菌株核苷酸和氨基酸同源性分别为99.3%和99.3%、88.9%和89.2%、88.9%和89.2%。按照核苷酸和氨基酸同源性分析可分成两个亚群,1号、2号菌株为一个亚群,3号、4号菌株为另一个亚群。N基因野毒株与CTN-1株、Flur-HEP株、CVS-11株和ERA株核苷酸同源性比对验证结果分别为:89.7%~95.5%、87.4%~88.3%、87.4%~87.9%和87.6%~88.5%;氨基酸同源性比对验证结果分别为:98.4%~99.1%、98.2%~98.6%、97.3%~98.9%和97.1%~97.3%。野毒株与CTN-1株核苷酸、氨基酸同源性最高,见表1。