《表5 四株埃可病毒6型(ECHO6)全基因组核苷酸(氨基酸)与原型株分区同源性分析》

《表5 四株埃可病毒6型(ECHO6)全基因组核苷酸(氨基酸)与原型株分区同源性分析》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《我国四株埃可病毒6型全基因组序列及重组特征分析》


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注:HUN09-25.湖南省2009年分离株;NX11-143.宁夏回族自治区2011年分离株;JS13-119.江苏2013年分离株;HEB15-54497H.河北2015年分离株。

由于3′UTR碱基的插入和缺失导致长度略有差异,本研究中的四株ECHO6全长分别为:HUN09、NX11:7 418bp;JS13、HEB15:7 419bp。参照D′Amori原型株(AY302558),基因注释详见表4。将四株ECHO6全长序列分别与D′Amori原型株(AY302558)进行核苷酸及氨基酸同源性分析(表5),结果显示在全基因组分析中,HUN09-25与原型株核苷酸同源性较高,达80.3%,JS13-19与原型株氨基酸同源性较高,为96.3%。分区段对比核苷酸同源性为74.2%~88.4%,氨基酸同源性为90.9%~99.0%。