《表3 由Gen Bank下载的25条埃可病毒6型（ECHO6）全基因组序列信息》

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《我国四株埃可病毒6型全基因组序列及重组特征分析》

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注：NPA.流感患者；HC.健康儿童；ARI.急性呼吸道感染。

对ECHO6各段编码区进行BLAST，筛选与其同源性较高的EV-B全长序列，并下载Gen Bank上ECHO6全基因组序列，去除错误、不完整和同源性较高的序列，保留25条用于系统发育树的构建（表3）。使用Sequencher 5.0软件编辑拼接序列，MEGA 5.0 (Sudhir Kumar，Arizona State University，Arizona USA）中的Clustal W对序列进行比对分析，最大自然法（Maximum likelihood method，ML）构建亲缘关系树，Bootstrap设置1 000。利用Simplot(3.5.1版本）软件对ECHO-6和其他EV-B流行株之间进行基因重组分析。分析参数为：Kimura(2-parameter）和Neighbor-Joining替代模型，间隔20个碱基（step:20bp），划分200nt的序列片段（window:200bp），核苷酸转换（transition）和颠换（transversion）速率比为2.0。