《表1 Gen Bank数据库中已注册的杆状病毒基因组信息》

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《昆虫杆状病毒基因组学研究进展》


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注:所有数据均来自https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/GenomesGroup.cgitaxid=10442。

自从1994年Ayres等[11]报道苜蓿银纹夜蛾核型多角体病毒(Autographa californica multiple nucleopolyhedrovirus,Ac MNPV)C6株的全基因组序列以来,随着分子生物学技术手段的飞速发展,已有73种杆状病毒全基因组被测定,包括45种α杆状病毒、22种β杆状病毒、1种δ杆状病毒、3种γ杆状病毒和2种未分类病毒(表1)。通过对不同杆状病毒基因组比较发现,其基因组大小介于80~180 kb,G+C含量在29%~58%,全长大于50个氨基酸的ORF有89~181个。这些ORF几乎均匀地分布在基因组DNA的2条链上,转录方向没有偏好性,基因之间的基因间序列非常短,甚至基因之间有重叠。非编码区占10%左右,主要由基因启动子序列、基因上游或下游非编码区和同源重复区(Homologous regions,hrs)组成。