《表4 4株埃可病毒11型(ECHO11)分离株与A1、D5基因型参考株VP1区氨基酸序列比较》

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《云南省4株埃可病毒11型VP1基因特征分析》


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注:*氨基酸在此处是空位;R.精氨酸;H.组氨酸;P.脯氨酸;E.谷氨酸;S.丝氨酸;K.赖氨酸;L.亮氨酸;T.苏氨酸;A.丙氨酸;G.甘氨酸;I.异亮氨酸;V.缬氨酸;W.色氨酸;C.半胱氨酸;Y.酪氨酸;D.天冬氨酸。

经MEGA 5.0软件对A1和D5基因亚型ECHO11分离株与参考株VP1区氨基酸序列进行比较(表4),结果发现两个基因亚型毒株在多个氨基酸位点上存在特异突变。在第13、54、91、108、114、175、219位上的特异突变应是两个基因亚型之间存在的特异突变。但D5-1簇基因亚型在多个位点中与A1基因亚型的氨基酸相同,并不与D5基因亚型D5-2、D5-3两簇的氨基酸相同,如第49、66、87、107、143、166、278位;而在某些位点上与D5-3簇基因亚型相同,如第69、99、174。值得注意的是D5-1簇基因亚型在第42、175和277位点特异突变与A1基因亚型和D5-2、D5-3两簇基因亚型氨基酸均不相同。