《表2 全球报道的埃可病毒9型（ECHO-9）基因（亚）型的时间分布》

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《2013-2019年全国手足口病ECHO-9的分子流行病学研究》

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对来自中国大陆的57条ECHO-9序列分析表明，除1株江西2019年分离到的ECHO-9外，所有的中国ECHO-9均属于D基因型，但其基因亚型随时间而改变（图4）。中国大陆2000-2005年仅有D1基因亚型的流行。2006-2010年间，D1基因亚型持续流行，并且出现D2和D3基因亚型的流行。但在2010年后，D1和D2基因亚型消失，D3成为绝对优势基因型。由于本研究测定的15株ECHO-9分离自2013-2019年，所以其中14株均属于D3基因亚型。然而，在2019年江西分离到一株ECHO-9属于C2基因亚型，这是中国大陆首次分离D基因型之外的毒株，推测其可能来源于境外。