《表1 埃可病毒9型(ECHO-9)各基因(亚)型的核苷酸和氨基酸平均差异》
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《2013-2019年全国手足口病ECHO-9的分子流行病学研究》
注:左下角为核苷酸平均差异,右上角为氨基酸平均差异。
基于127条ECHO-9 VP1全长序列构建系统发育进化树(图3),并计算各基因(亚)型间的核苷酸和氨基酸平均差异(表1),ECHO-9可被划分为A、B、C、D、E、F和G七个基因型。A基因型仅包括1953年在健康儿童粪便中分离的原型株Hill株。B基因型是由1959年分离自AM病例中的原型株Barty株、1982年分离自罗马尼亚和2001年分离自法国的3株毒株组成。C基因型分离自北美洲、欧洲、亚洲的7个国家。D基因型作为最主要基因型,毒株分离地域范围最广,共包括分离自亚洲、欧洲、北美洲和大洋洲的10个国家的92个毒株,其中以亚洲为最多(70株)。E基因型所包括的5株毒株,分别分离自欧洲(法国,3株)、大洋洲(澳大利亚,1株)和北美洲(美国,1株)。F基因型虽包含毒株数目较少,但其分离地理区域较广,包括亚洲(日本,1株)、欧洲(法国,3株)、大洋洲(澳大利亚,3株)、北美洲(美国,1株)和非洲(突尼斯,1株)。G基因型是由分离自北美洲(美国,1株)和亚洲(印度,1株)的2株毒株组成。
图表编号 | XD00188489800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2021.01.01 |
作者 | 司芬芬、卫海燕、关路媛、冀天娇、王东艳、张勇、祝双利、宋洋、韩振志、李俊含、许文波、严冬梅 |
绘制单位 | 国家脊髓灰质炎实验室世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室国家卫生健康委员会生物安全重点实验室国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所、河南省疾病预防控制中心、陕西省疾病预防控制中心、国家脊髓灰质炎实验室世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室国家卫生健康委员会生物安全重点实验室国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所、国家脊髓灰质炎实验室世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室国家卫生健康委员会生物安全重点实验室国家 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |