《表1 盐城市4株E-18毒株与各基因型参考株VP1区核苷酸和氨基酸同源性》

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《盐城市1起病毒性脑炎疫情的肠道病毒Echovirus18VP1基因分子特征》

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4例肠道病毒核酸阳性标本进行VP1基因片段半巢式PCR扩增、测序，经BLAST比对确认为E-18型VP1基因核苷酸序列。病毒株VP1基因片段均未见核苷酸的插入或者缺失，长度均为861bp、编码287个氨基酸。4株病毒株VP1基因组内核苷酸、氨基酸同源性分别为99.9%～100.0%和100.0%；与2019年E-18型手足口病盐城株（151/HFMD/JSYC/2019)VP1基因核苷酸、氨基酸同源性分别为99.5%～99.7%和100.0%；与原型株Metcalf VP1基因核苷酸、氨基酸同源性分别为79.0%～79.1%和93.4%；与其他各基因型参考株之间的VP1基因核苷酸、氨基酸序列同源性见表1。