《表3 J098/YN/CHN/2014分离株与各基因型参考株VP1区氨基酸序列比较》

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《云南省2014年1株肠道病毒71型B5亚型病毒全基因组序列分析》

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注：R为精氨酸（arginine) ；Q为谷氨酰胺（glutamine) ；H为组氨酸（histidine) ；P为脯氨酸（proline) ；E为谷氨酸（glutamic acid) ；S为丝氨酸（serine) ；K为赖氨酸（lysine) ；L为亮氨酸（leucine) ；T为苏氨酸（threonine) ；A为丙氨酸（alanine) ；G为甘氨酸（glycine) ；I为异亮

经MEGA 5.0软件对J098/YN/CHN/2014毒株与其他基因型参考株的VP1区基因的氨基酸序列进行比较（表3），结果显示毒株在第22、43、58、145、184、240、249、289位氨基酸上与其他基因型参考株存在特异突变。相比较其他基因型，B基因型VP 1区氨基酸在第43位由K→E，第58位由A→T，第184位由S→T，第2 4 0位由T→S。B 5型毒株分支a的第22位氨基酸主要是R，而分支b及其他大部分基因型均为Q，其中目前流行株C4a型突变为H。第145位氨基酸在大多数基因型中主要还是E，少部分基因型突变为G、Q、A、R。第249位氨基酸在不同基因型之间出现有V和I两种氨基酸，第289位也出现有T和A两种氨基酸。