《表2 龙岗区2017年27份CVA16和CVA16各基因亚型代表株VP1区核苷酸和氨基酸序列同源性分析》

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《深圳市龙岗区2017年手足口病病原柯萨奇病毒A16型及肠道病毒71型VP1区基因特征分析》

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获得27份CVA16的完整VP1片段，19份成功上传至Genbank（accession numbers:MH644613～MH644631），同源性分析显示，其核苷酸和推测的氨基酸序列同源性分别为87.9%～100.0%、97.8%～100.0%。辖区CVA16序列与Genbank中各基因亚型的代表株[7]进行同源性比对，发现2017年龙岗区CVA16序列主要分为两大部分，分别与B1a和B1b基因型高度同源，见表2。