《表1 VP1区核苷酸及氨基酸序列同源性比对(%)》

《表1 VP1区核苷酸及氨基酸序列同源性比对(%)》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《引起一起暴发性急性胃肠炎疫情的埃可病毒18型VP1基因特征分析》


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注:*E18 Metcalf代表株序列。

根据Brown B A等[7]对EV及Chen X等[8]对E18的分型标准,即以全长VP1区序列为基础,核苷酸差异大于15%可分为不同基因型的原则,120株E18可分为A、B、C、D和E五个基因型,大部分毒株分布在C基因型中(表1)。D基因型均为印度分离株,其核苷酸相似性为95.8%~98.6%;B基因型由2005年的中国山东分离株构成。Bootstrap值>99%及核酸平均差异率达13.8%,可将C基因型进一步划分为C1及C2亚型。C2亚型中,除2015年的河北分离株He B15-462/He B/CHN/2015(Gen Bank登录号:MK256761)及2017年浙江分离株LC/48/17/E18(Gen Bank登录号:MH118977)以外,其他中国分离株则归属C2a分支,其与分支外序列差异率均>6.3%(Bootstrap值>99%)(图1)。