《表1 VP1区核苷酸及氨基酸序列同源性比对(%)》
提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
本系列图表出处文件名:随高清版一同展现
《引起一起暴发性急性胃肠炎疫情的埃可病毒18型VP1基因特征分析》
注:*E18 Metcalf代表株序列。
根据Brown B A等[7]对EV及Chen X等[8]对E18的分型标准,即以全长VP1区序列为基础,核苷酸差异大于15%可分为不同基因型的原则,120株E18可分为A、B、C、D和E五个基因型,大部分毒株分布在C基因型中(表1)。D基因型均为印度分离株,其核苷酸相似性为95.8%~98.6%;B基因型由2005年的中国山东分离株构成。Bootstrap值>99%及核酸平均差异率达13.8%,可将C基因型进一步划分为C1及C2亚型。C2亚型中,除2015年的河北分离株He B15-462/He B/CHN/2015(Gen Bank登录号:MK256761)及2017年浙江分离株LC/48/17/E18(Gen Bank登录号:MH118977)以外,其他中国分离株则归属C2a分支,其与分支外序列差异率均>6.3%(Bootstrap值>99%)(图1)。
图表编号 | XD00188491700 严禁用于非法目的 |
---|---|
绘制时间 | 2021.01.01 |
作者 | 周健明、谢显清、方苓、金玉娟、曾汉日、李静媚、刘凤仁、李彩霞、李晖、刘渠、张勇、郑焕英 |
绘制单位 | 深圳市龙岗区疾病预防控制中心、深圳市龙岗区疾病预防控制中心、广东省疾病预防控制中心、深圳市龙岗区疾病预防控制中心、广东省疾病预防控制中心、深圳市龙岗区疾病预防控制中心、深圳市龙岗区疾病预防控制中心、广东省疾病预防控制中心、广东省疾病预防控制中心、深圳市龙岗区疾病预防控制中心、中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所、广东省疾病预防控制中心 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |