《表5 不同PBoV毒株各编码基因间的核苷酸序列及其推导氨基酸序列同源性比对分析结果(%)》

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《3株猪博卡病毒的全基因遗传进化及重组分析》


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未加粗数据为各编码基因的核苷酸序列同源性;加粗数据为各编码基因的推导氨基酸序列同源性

在获得的3条PBoV全基因序列(毒株)间,GXBH2014株与GXBH2015株的同源性较高,二者的NS1基因、NP1基因和VP1/VP2基因核苷酸序列同源性分别为83.1%、84.7%和82.2%,对应的推导氨基酸序列同源性分别为81.0%、78.8%和78.8%;但GXBH2014株和GXBH2015株与GXLC2014株各编码基因间的核苷酸序列及其推导氨基酸序列同源性均低于55.0%。GXBH2014株、GXBH2015株和GXLC2014株与各基因群参考毒株分别进行同源性比对分析,结果显示,GXBH2014株和GXBH2015株与PBoVG3基因群参考毒株SH20F各编码基因的推导氨基酸序列同源性较高,为70.9%~98.5%;GX-LC2014株与PBoVG1基因群参考毒株SX各编码基因的推导氨基酸序列同源性最高,为98.0%~99.1%。各毒株间的同源性分析结果见表5。