《表2 鸡FGF13核苷酸和氨基酸序列与其他物种的同源性比对》

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《鸡FGF13基因生物信息学及组织表达分析》


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从NCBI数据库中获取的鸡FGF13基因(登录号XM_015278209.2)的CDS序列,全长582 bp,共编码193个氨基酸。利用DNAMAN软件将鸡FGF13基因CDS序列及氨基酸序列与GenBank中其他物种该基因序列及其翻译的氨基酸序列进行同源性比对分析,结果见表2和图1。由表2可知,鸡FGF13核苷酸及其编码的氨基酸序列与所列举动物同源性均较高,其中与鸽和火鸡的同源性最高,分别达到97.8%、100.0%以及96.6%、97.4%,而与鱼类及两栖类同源性相对较低,其中核苷酸序列与斑马鱼的同源性最低,为79.0%,氨基酸序列与非洲爪蟾同源性最低,为90.7%。系统进化树分析表明(见图1),鸡与鸽和火鸡聚为一簇,表明鸟类之间FGF13基因进化水平更为接近,绵羊、牛、人、小鼠和大鼠聚为一簇,表明这些哺乳动物之间的遗传关系更近,而斑马鱼和非洲爪蟾各单独一个分支,且与鸡的亲缘关系最远,该结果与同源性分析结果相一致,同时也符合物种进化的规律,表明不同物种中该基因分子水平上差异。