《表1 生物信息学分析工具和相应网址信息》

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《鸡FGF13基因生物信息学及组织表达分析》


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利用DNAMAN软件将获得的鸡FGF13基因的CDS序列进行翻译,同时与人、小鼠、斑马鱼等其他物种的该基因序列进行同源性比较分析,并构建系统发育树。利用ProtParam在线工具分析FGF13基因编码蛋白的基本理化性质;通过NetPhos2.0和NetOGlyc3.1预测FGF13氨基酸存在的磷酸化、糖基化位点;采用ProtScale工具进行氨基酸序列的亲水性分析;利用Smart进行氨基酸序列的保守结构域分析和预测;运用TargetP和PSORTⅡPrediction预测蛋白质的亚细胞定位;利用Hopfield神经网络预测蛋白质的二级结构;通过Swiss-model预测蛋白质的三级结构。具体分析工具和相应网址见表1[15]。