《表4 短片段序列数据分析的生物信息学分析工具》

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《鸭肠炎病毒感染对鸭肠道黏膜组织转录组变化分析》


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将上述得到的单链环状DNA文库称为Raw reads或Raw data,随后Raw reads进行质控(QC),将过滤之后的Clean reads比对到参考基因组上。比对完后,通过统计比对率、Reads在参考序列上的分布情况等使用段片段序列分析工具(表4)。比对结果第二次质控(QC of alignment),则进行基因主成分、相关性、差异基因筛选等等,并对筛选出的样品间差异表达基因,进行GO、pathway、聚类、蛋白互作网络和转录因子等更深入的挖掘分析。