《表2 ORFV各毒株的OVIFNR基因核酸和氨基酸同源性比对结果》

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《羊传染性脓疱病毒OVIFNR蛋白结构分析与B细胞表位预测》

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注：右上部分为核酸序列比对，左下部分为氨基酸序列比对。

PCR扩增得到大小约552 bp的基因片段，与预期结果一致。序列测定结果显示，OVIFNR基因大小为552 bp，编码184个氨基酸，GC含量为60.51%。将该基因序列提交GenBank，获得序列号为KF916586，将所含该基因的毒株命名为orfvchGanSu。将GenBank上公布的参考毒株（挑选了14株，具体信息见表1）以及orfv-chGanSu的OVIFNR基因进行核酸序列的多序列比对。结果（表2）显示：有两对毒株的OVIFNR基因序列同源性为100%，分别是Ena和Matsumoto株、Hoping和Nantou株。orfv-chGanSu的OVIFNR基因序列与Hoping和Nantou株的同源性最高，为99.6%；orfv-chGanSu与Hoping和Nantou株在198位和273位上分别有2个单核苷酸不同（在198位上orfv-chGanSu是C，Hoping和Nantou是T，在273位上orfv-chGanSu是T，Hoping和Nantou是C），但都没有氨基酸序列的不同。orfvchGanSu和D1701株的同源性最低，为95.3%；orfv-chGanSu和NZ2、OV-SA00、OV-IA82株的同源性分别为96.0%、97.5%、96.7%。这些数据说明ORFV各毒株的OVINR基因发生了突变（包括orfv-chGanSu）。