《表1 PEDV毒株和常见毒株的同源性比对结果》

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注:CV777是中国经典毒株的疫苗毒株,JS2008是中国经典毒株,CH-HNZZ47-2016、AJ1102、CH-LNC-2012S、PEDV4-S-3是国内最新的流行毒株,SouthKorea-2008是韩国经典毒株,KDGG13-2013是韩国流行毒株,USA2014为美国流行毒株。

同源性分析显示,送检毒株的基因组序列与我国AJ1102的同源关系最近,相似性为97.5%,而AJ1102、CH-HNZZ47-2016、CH-LNC-2012S、PEDV4-S-3这几支毒株是国内最新的流行毒株,送检毒株与他们相似性较高。送检毒株与韩国毒株South Korea-2008、美国毒株USA2014的序列相似性均为96.8%,而与CV777疫苗毒株的相似性较低,为87%(表1)。