《表1 我国部分地区分离的PEDV毒株与CV777株、DR13株同源性分析》

《表1 我国部分地区分离的PEDV毒株与CV777株、DR13株同源性分析》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《我国部分地区猪流行性腹泻、传染性胃肠炎及猪轮状病毒感染的流行现状及防控措施》


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注:参考毒株(1)疫苗株CV777;(2)韩国弱毒疫苗株DR13。Note:Reference strains of vaccine strain CV777,South Korea attenuated vaccine strain DR13.

我国中东部部分地区分离的PEDV毒株与国内疫苗毒株CV777、韩国弱毒疫苗株DR13同源性分析,结果见表1。从表1可以看出,我国不同地区分离的PEDV毒株与近年来中国毒株、韩国毒株及泰国毒株亲缘关系较近,90%的流行毒株都属于G2群,但与国内疫苗毒株CV777、韩国AttenuatedDR13弱毒株亲缘关系较远,疫苗株属于G1群,表明流行毒株与传统毒株(2012年之前)的基因相比存在较大变异,这也是疫苗毒株CV777在各地免疫保护力不佳的主要原因[3-5]。目前国内除流行与PEDV疫苗株相同的毒株外,还存在新基因型的PEDV株[4],且为强毒株[6]。因此,应高度关注当前PEDV毒株的遗传变异情况,从中筛选出新的疫苗候选毒株,尽快研制新的疫苗以控制我国PED疫情[7]。TGEV不同地区来源的各毒株间S基因差异性不大,S基因变异仍较低且相对比较稳定,这有可能是目前TGEV感染率较低的原因[8-9]。孙秋艳等[10]将山东分离株与Bank中公布的13株TGEV毒株的S基因序列进行同源性比较,发现核苷酸同源性在98.2%~77.7%,虽然分离毒株与其他13株TGEV毒株核苷酸同源性差异较大,但氨基酸同源性却很高(96.0%~99.4%),说明S基因点突变很多应该是无意义突变。A群PoRV基于VP4和VP7的抗原性不同,将其分为血清型P型和G型。目前全球优势流行株为G1占42.9%,G2占11.8%,G3占11.1%,G4占8.2%,G9占14.4%,共计88.2%,我国的优势流行株与全球流行趋势一致[11]。杨娟等[12]对分离的PoRV广东株鉴定发现,VP7和VP4基因都与典型的A群轮状病毒OSU株在同一分支上,属于比较流行的毒株,与轮状病毒疫苗毒株LLR进化距离较远,表明其不属于疫苗毒株。