《表2 3株DTMUV各蛋白与参考毒株的同源性分析结果》

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《鸭坦布苏病毒山东流行株的分离鉴定及其基因组序列分析》


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将分离株482、SDTA487和SDZB567的目的片段测序、分析后,获得3株DTMUV的全基因组序列,其全长均为10 993 bp,仅包括1个10278 bp的ORF,编码3 425个氨基酸。从NCBI上选取不同年份的24株TMUV,将其与本研究获得的482、SDTA487和SDZB567毒株进行序列分析,结果发现3个分离株彼此之间的氨基酸同源性为99.2%~99.3%,与24株参考毒株的同源性为95.8%~99.9%。具体各蛋白的同源性分别为:C蛋白,86.1%~99.2%;M蛋白,91.6%~100%;E蛋白,95.0%~99.4%。非结构蛋白NS1,92.3%~99.7%;NS2A,90.7%~99.1%;NS2B,95.4%~99.2%;N S 3,9 7.9%~1 0 0%;N S 4 A,9 4.6%~9 9.3%;NS4B,97.2%~100%;NS5,97.8%~99.9%。详细结果见表2。以ORF核苷酸进行系统发育树分析,发现482、SDTA487和SDZB567毒株与近年来分离的TMUV毒株(AH201501,JS201501等)亲缘关系更近,属于中国株I型(图4)。