《表2 3株DTMUV各蛋白与参考毒株的同源性分析结果》
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《鸭坦布苏病毒山东流行株的分离鉴定及其基因组序列分析》
将分离株482、SDTA487和SDZB567的目的片段测序、分析后,获得3株DTMUV的全基因组序列,其全长均为10 993 bp,仅包括1个10278 bp的ORF,编码3 425个氨基酸。从NCBI上选取不同年份的24株TMUV,将其与本研究获得的482、SDTA487和SDZB567毒株进行序列分析,结果发现3个分离株彼此之间的氨基酸同源性为99.2%~99.3%,与24株参考毒株的同源性为95.8%~99.9%。具体各蛋白的同源性分别为:C蛋白,86.1%~99.2%;M蛋白,91.6%~100%;E蛋白,95.0%~99.4%。非结构蛋白NS1,92.3%~99.7%;NS2A,90.7%~99.1%;NS2B,95.4%~99.2%;N S 3,9 7.9%~1 0 0%;N S 4 A,9 4.6%~9 9.3%;NS4B,97.2%~100%;NS5,97.8%~99.9%。详细结果见表2。以ORF核苷酸进行系统发育树分析,发现482、SDTA487和SDZB567毒株与近年来分离的TMUV毒株(AH201501,JS201501等)亲缘关系更近,属于中国株I型(图4)。
图表编号 | XD00215374100 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2021.01.20 |
作者 | 赵君、姜胜男、李刚、杨玉栋、李宁、刘思当 |
绘制单位 | 山东农业大学动物科技学院山东省动物生物工程与疾病防治重点实验室山东省畜禽疫病防制工程技术研究中心、山东农业大学动物科技学院山东省动物生物工程与疾病防治重点实验室山东省畜禽疫病防制工程技术研究中心、山东农业大学动物科技学院山东省动物生物工程与疾病防治重点实验室山东省畜禽疫病防制工程技术研究中心、山东农业大学动物科技学院山东省动物生物工程与疾病防治重点实验室山东省畜禽疫病防制工程技术研究中心、山东农业大学动物科技学院山东省动物生物工程与疾病防治重点实验室山东省畜禽疫病防制工程技术研究中心、山东农业大学动物科技 |
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