《表3 GDYH-Y1分离株同源性分析》

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《广东地方品种鸡J亚群禽白血病病毒分离鉴定及遗传进化研究》

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注：括号内为氨基酸同源性，括号外为核苷酸同源性。

应用DNAStar(Ver 7.0）基因分析软件，对测序结果进行核苷酸序列剪切、拼接和序列相似性比较。应用MEGA(Ver 7.0）分析软件，将获得的ALV毒株与GenBank中已公开的不同亚群ALV毒株基因组序列进行系统发育分析，用邻接法（neighbor-joining）生成系统发育树，用bootstrap值来评估进化树的可靠性。使用Soft Berry(http：/linux1.softberry.com/berry.html）的NSITE分析工具进行转录调控元件分析。用于比较分析的不同亚群ALV参考株信息及基因登录号见表3。