《表2 ENTV-2FJ与其他分离株同源性比较》

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《山羊地方性鼻内肿瘤病毒ENTV-2FJ株的分离纯化和全基因组序列分析》

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ENTV-2FJ株的gag和env基因核苷酸序列和编码蛋白氨基酸序列与其他分离株的相似性见表2。ENTV-2FJ株与enENTV及enJSRV比较，在gag基因621 bp后缺失8个碱基。ENTV-2FJ株gag基因编码蛋白氨基酸与enENTV、ENTV-1、JSRV的位点差异主要位于115～132及169～201 aa。ENTV-2FJ株与enENTV及enJSRV比较，在env基因7 091～7 095 bp处插入CTGAA 5个碱基，在7 111～7 117 bp处插入TACCGAA 7个碱基。gag基因进化树分析和gag基因编码蛋白氨基酸序列分析结果均显示ENTV-2FJ与ENTV-2SC、ENTV-2CQ1、ENTV-2Shaanxi、ENTV-2Shaanxi2、ENTV-2Shaanxi3、ENTV-2Shaanxi4处于进化树同一分支（图5；图6）。ENTV-2FJ株的env基因氨基酸序列与enENTV-CHN2株的主要差异位点在6、13、82、86、115、126、152、180～181、229、283、549、555、559～562、564～569、591-599 aa。env基因进化树分析结果显示ENTV-2FJ株的env基因与ENTV-2SC、处于进化树同一分支（图7）；ENTV-2FJ株在env蛋白的597～600位有个YRSM基序（图8）。ENTV-2FJ株env氨基酸序列与ENTV-2-AY197548.2（国外株）有34个氨基酸差异，其中18个氨基酸差异位于囊膜蛋白的表面蛋白区，16个氨基酸差异位于囊膜蛋白的跨膜蛋白区。env基因编码蛋白氨基酸序列分析结果显示ENTV-2FJ与ENTV-2SC、ENTV-2Shaanxi、ENTV-2Shaanxi2、ENTV-2Shaanxi3、ENTV-2Shaanxi4处于进化树同一分支（图9）。