《表1 LMBIV-NB001株MCP基因部分序列与其他虹彩病毒的同源性比较》

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《一株大口黑鲈(Micropterus salmoides)虹彩病毒(Iridoviridae)的分离及鉴定》


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提取的病鱼肝脏、脾脏、肾脏和肌肉组织DNA分别采用引物LMBV-F和LMBV-R进行PCR扩增,均获得长度约1kb的目的条带(图4a),将其切胶回收、连接至pMD19-T simple克隆载体,转化TG1感受态细胞,涂平板培养后选取6个菌落,扩大培养后抽提质粒,进行PCR鉴定,结果如图4b所示,所选菌落的PCR扩增产物在约1kb处有明显条带,与预期结果相同。选取其中的2个阳性克隆菌落进行PCR扩增产物测序,获得长度为1029bp的序列,经NCBI数据库中BLAST比对,Bioedit软件分析,结果显示,扩增得到的序列与鳜鱼蛙病毒NH-1609、大口黑鲈溃疡综合征病毒BG/TH/CU3、EPC060608-08的MCP核苷酸同源性最高,相似度均为99.13%(表1)。系统进化分析结果表明,本研究分离得到的病毒与鳜鱼蛙病毒、大口黑鲈溃疡综合征病毒聚成一簇,属于虹彩病毒科的蛙病毒属(图5),将其命名为大口黑鲈虹彩病毒宁波分离株(Largemouth bass iridovirus,LM BIV-NB001),上传至GenBank后获得的登录号为MN176304。