《表2 PEDV部分S基因核苷酸序列同源性比较 (单位:%)》

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《云南部分地区猪流行性腹泻病毒S基因克隆与序列分析》

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将云南安宁、宣威、临沧、富民地区所测得的PEDV S基因的部分核苷酸序列推导的氨基酸序列与我国13个PEDV参考毒株、2个韩国毒株和1个比利时毒株比较，根据核苷酸序列，可以将其分为3个群，即G1、G2、G3。云南地区G1群PEDV部分S基因的核苷酸同源性为96.7%～100.0%，推导的氨基酸序列的同源性为95.0%～100%。与G2、G3群的同源性分别为94.6%～97.3%、93.7%～95.6%，推导的氨基酸序列的同源性分别为93.1%～98.1%、91.9%～94.6%。G2群内核苷酸同源性为97.4%～99.1%，推导的氨基酸序列同源性为96.1%～99.6%，与G3群内核苷酸同源性为95.0%～97.7%，推导的氨基酸同源性为93.1%～96.5%；G3群内核苷酸同源性为99.1%，推导的氨基酸序列同源性为98.8%（见表2、表3）。