《表1 vp60基因核苷酸序列同源性分析》

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《一株兔出血症病毒2型鉴定与vp60基因序列分析》


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注:1为新分离的RHDV2毒株CD202004;2-7为RHDV2毒株,登录号分别为MN061492、KY247124、KY783700、MG356948、MK521927、MN0894670;8-15为经典RHDV毒株,登录号分别为MK814817、DQ530363、JN165234、KF494906、KJ814618、KJ943793、KJ943794、Y15426;16为RCV毒株,登录号为LT708

经测序,扩增的基因序列大小为810 bp,将该序列并上传至GenBank数据库中(登录号:MT495252),将其命名为CD202004。经比对,其与荷兰分离株(登录号:MN061492)的核苷酸序列一致性最高,为97.77%。其与经典RHDV的vp60基因(登录号:MK814817、DQ530363、JN165234、KF494906、KJ814618、KJ943793、KJ943794、Y15426)的核苷酸序列一致性为77.85%~80.94%;与RCV的vp60基因(登录号:LT708127)的核苷酸序列一致性为78.96%;与RHDV2的vp60基因(登录号:MN061492、KY247124、KY783700、MG356948、MK521927、MN0894670)的核苷酸序列一致性为93.81%~97.77%。见表1。