《表1 GenBank中与GX238株各基因节段开放阅读框核苷酸序列同源性最高的病毒株》
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《一株新型三源重配H1N2亚型猪流感病毒的进化分析及对小鼠的感染性研究》
对GX238株病毒提取RNA,经RT-PCR分节段扩增后,获得预期大小的目的条带,对PCR产物胶回收、纯化进行测序,利用Seq Man软件对序列结果进行全基因拼接。应用BLAST程序对拼接好的完整序列进行比对,得到与分离株8个节段核苷酸序列同源性最高的8个病毒株(表1)。结果显示HA基因与分离自美国的A/swine/Indiana/A01943834/2016(H1N2)核苷酸相似性最高,NS基因与A/swine/Indiana/A01727685/2015(H1N2)核苷酸相似性最高,其余节段均与A/swine/Indiana/A01812050/2015(H1N2)核苷酸相似性最高,相似性均可达98.9%以上,表明病毒可能从A/swine/Indiana/A01812050/2015(H1N2)类病毒进化而来。
图表编号 | XD00228847200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.09.01 |
作者 | 钟秋、张丹丹、宋祖晨、孟飞、陈艳、乔传玲、陈化兰、曹允考、杨焕良 |
绘制单位 | 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室、农业农村部动物流感重点开放实验室、东北农业大学动物医学院、中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室、农业农村部动物流感重点开放实验室、中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室、农业农村部动物流感重点开放实验室、中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室、农业农村部动物流感重点开放实验室、中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室、农业农村部动物流感重点开放实验室、中国农业科学院哈尔滨兽医研 |
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