《表2 与SW/GX/P2/2011株和SW/GX/P3/2011株各基因片段核苷酸序列相似性最高的参考毒株》

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《2株广西猪源H9N2亚型流感病毒遗传进化及生物学特性分析》

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广西猪源H9N2亚型流感病毒SW/GX/P2/2011株和SW/GX/P3/2011株经基因克隆测序得到的核苷酸序列开放阅读框（ORF）分别是PB2:2280 bp、PB1:2274 bp、PA:2151 bp、HA:1683 bp、NP:1497bp、NA:1410 bp、M:982 bp和NS:838 bp。使用NCBI中的BLAST进行比对分析，获得与2株广西猪源H9N2亚型流感病毒各基因片段核苷酸序列相似性最高的参考毒株（表2）。利用MEGA 5.0对SW/GX/P2/2011株和SW/GX/P3/2011株的各基因片段进行遗传进化分析，其中，基于HA基因核苷酸序列的遗传进化分析显示这2株猪源H9N2亚型流感病毒与A/duck/Hong Kong/Y280/97株属于同一分支（图2），为BJ/94系中的Y280亚系；基于NA基因核苷酸序列的遗传进化分析显示这2株猪源H9N2亚型流感病毒与A/chicken/Hong Kong/G9/97株属于同一分支，为BJ/94系中的G9/97亚系；基于NS基因核苷酸序列的遗传进化分析显示这2株猪源H9N2亚型流感病毒与A/chicken/Shanghai/F/98株属于同一分支，为BJ/94系中的F/98亚系；基于PB1、PA和NP基因核苷酸序列的遗传进化分析均显示这2株猪源H9N2亚型流感病毒属于F/98亚系；基于PB2基因核苷酸序列的遗传进化分析显示这2株猪源H9N2亚型流感病毒与A/duck/Shantou/2102/2000株属于同一分支，属于DK1系；基于M基因核苷酸序列的遗传进化分析显示这2株猪源H9N2亚型流感病毒与A/quail/Hong Kong/G1/97株属同一分支，属G1/97系。由于SW/GX/P2/2011株和SW/GX/P3/2011株的基因组成与目前广泛流行的G57基因型（图3）相一致，故确定广西猪源H9N2亚型流感病毒为G57基因型。