《表1 ORFV分离株F1L基因核苷酸和氨基酸同源性分析》
注:右上为核苷酸序列同源性(%),左下为氨基酸序列同源性 (%)
用DNAMAN软件对测序所得的疫苗株和分离株F1L基因核苷酸序列进行比较分析。结果显示:两者的核苷酸序列同源性为95.9%,共发现42处变异。运用BLAST软件,将2个序列与GenBank上同属的其他毒株进行核苷酸序列同源性比较(表1),发现本次测定的ORFV疫苗株、分离株F1L基因的核苷酸序列和氨基酸序列与其他毒株的相似性分别为96.4%~97.5%,97.8%~99.1%。通过系统进化树分析发现,本次测定的ORFV分离株F1L基因核苷酸与2015年公布的毒株KP339950.1同源性最高,同时与毒株KP339949.1以及KX029229.1较为接近,处在同一进化分支上(图1)。
图表编号 | XD0099239700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.08.10 |
作者 | 王文莉、魏楠楠、徐守兴、卢炳洲、张大俊、张克山、郑海学、刘湘涛 |
绘制单位 | 甘肃省动物疫病预防控制中心、中国农业科学院兰州兽医研究所家畜疫病病原生物学国家重点实验室农业部畜禽病毒学重点开放实验室国家口蹄疫参考实验室、中国农业科学院兰州兽医研究所家畜疫病病原生物学国家重点实验室农业部畜禽病毒学重点开放实验室国家口蹄疫参考实验室、中国农业科学院兰州兽医研究所家畜疫病病原生物学国家重点实验室农业部畜禽病毒学重点开放实验室国家口蹄疫参考实验室、中国农业科学院兰州兽医研究所家畜疫病病原生物学国家重点实验室农业部畜禽病毒学重点开放实验室国家口蹄疫参考实验室、中国农业科学院兰州兽医研究所家畜疫 |
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