《表1 ORFV分离株F1L基因核苷酸和氨基酸同源性分析》

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《羊口疮病毒疫苗株和野毒株F1L基因的比较分析》


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注:右上为核苷酸序列同源性(%),左下为氨基酸序列同源性 (%)

用DNAMAN软件对测序所得的疫苗株和分离株F1L基因核苷酸序列进行比较分析。结果显示:两者的核苷酸序列同源性为95.9%,共发现42处变异。运用BLAST软件,将2个序列与GenBank上同属的其他毒株进行核苷酸序列同源性比较(表1),发现本次测定的ORFV疫苗株、分离株F1L基因的核苷酸序列和氨基酸序列与其他毒株的相似性分别为96.4%~97.5%,97.8%~99.1%。通过系统进化树分析发现,本次测定的ORFV分离株F1L基因核苷酸与2015年公布的毒株KP339950.1同源性最高,同时与毒株KP339949.1以及KX029229.1较为接近,处在同一进化分支上(图1)。