《表3 CSFV CN-FJLY株与其他毒株核苷酸及推导氨基酸同源性的比较》

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《福建省一株猪瘟病毒流行毒株全基因组序列测定与分析》

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注:粗体为核苷酸同源性，斜体为氨基酸同源性。Noet:Bold is nucleotide homology and italic is amino acid homology.

将CN-FJLY毒株的各片段测序结果进行拼接，结果显示毒株基因组全长为12 296bp（登录号:MF679604）。为了进一步分析CN-FJLY毒株的基因组特性，将CN-FJLY毒株的各基因（Npro、C、Erns、E1、E2、p7、NS2、NS3、NS4A、NS4B、NS5A、NS5B）及非编码区（5′UTR和3′UTR）与参考株（HCLV、Shimen、SXCDK、HEBZ、GXWZ02、HN-LY-2011和Zj0801）进行核苷酸和推导氨基酸序列较分析。结果显示，CN-FJLY毒株的全基因组与处于2.1b亚群的HEBZ和GXWZ02同源性最高，为95.1%~97.0%，与处于1.1亚群的HCLV和Shimen的同源性最低，为81.5%~83.7%（表3）。与参考毒株相比，CN-FJLY毒株变异程度较大的是5′UTR、E2、P7、NS2、NS5A和3′UTR（表3）。