《表2 2019年盐城市4株E-18型肠道病毒VP1基因编码氨基酸变异位点分析》

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《盐城市1起病毒性脑炎疫情的肠道病毒Echovirus18VP1基因分子特征》

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盐城4株E-18型肠道病毒VP1基因编码氨基酸与原型株Metcalf相比，涉及19个氨基酸位点的变异，变异率为6.62%(19/287）。2019年1株手足口病E-18盐城代表株与4株病毒性脑炎代表株编码氨基酸一致，变异位点一致。据Chen等[14]报道，E-18型肠道病毒VP1蛋白的B-C loop结构区78～89位氨基酸位点是重要的中和抗原表位，其位点的变异可能直接影响病毒逃脱宿主的中和免疫，盐城病毒性脑炎4株代表株与1株手足口病代表株在84位氨基酸位点均发生了R84N的变异。见表2。