《表2 CV-A2同基因（亚）型内或不同基因（亚）型毒株间VP1区核苷酸序列的一致性比较分析（%）》

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《北京市朝阳区2012-2015年柯萨奇A2型肠道病毒的基因特征分析》

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聚类结果显示（图1) :（1）所有VP1序列聚类为5个基因型（A～E型）：中国的序列为B型（2条）和D型（57条）；其他地区的序列为A型（1条）、C型（9条）和E型（6条），原型株AY421760独立代表A型；6条本研究的序列分别位于D1亚型（5条）和D2亚型（1条）。（2）核苷酸序列一致性分析结果显示（表2）:D型序列平均一致性最高为96.4%，C型序列平均一致性最低为89.2%；基因型间的一致性分析结果显示同属国外序列的C型和E型平均一致性最高为85%，而同为中国地区的序列D型和B型的核苷酸一致性（81.1%）低于D型/E型（82.5%）和D型/C型（83.2%）；6条本研究序列的核苷酸一致性为93.4%～98.5%（均值96.2%），与AY421760.1的核苷酸一致性为80.5%～81.6%（均值81.2%）。（3）同源性分析结果显示：2012年的序列v183、v880和v890分别与中国的KC867047（广东/2009）、JX867333（香港/2012）和KP289360（温州/2013）同源性最高，2013年的序列13331与KP006006（广东/2013）同源性最高，2015年的序列15548和15673与KU677987（河南/2015）和KX156352（广东/2013）同源性最高。（4）中国地区的核苷酸序列时间聚类分析显示：B型、D2亚型、D3亚型及D1亚型形成了一个较为完整的时间轴，即2009年以前—（2009-2012）年—（2012-2016）年。（5) VP1氨基酸序列分析显示，国内外序列变异位点主要有6处，分别是S21N、S21D、T60S、Q145R、V146H、V146T、S215N、S215T、S215A和T291S。6条本研究的氨基酸序列在6个变异位点处的氨基酸与国内其他地区的完全一致。