《表3 本研究中2株CV-A2 (v890、15673)与其他A组肠道病毒的编码蛋白序列的核苷酸一致性比较》

《表3 本研究中2株CV-A2 (v890、15673)与其他A组肠道病毒的编码蛋白序列的核苷酸一致性比较》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《北京市朝阳区2012-2015年柯萨奇A2型肠道病毒的基因特征分析》


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从NCBI中搜索A组肠道病毒的编码蛋白序列作为参考株分析(表3),分别针对编码蛋白基因及P1、P2和P3基因进行核苷酸一致性分析和聚类分析,并构建进化树。系统进化树显示(图2),在编码蛋白序列(6 573bp)和P1基因(2 577bp)进化树中,v890和15673及其他13条CV-A2病毒聚为一簇,v890和15673与AY421760.1的核苷酸一致性高于其他A组肠道病毒;在P2 (1 734bp)和P3 (2 259bp)基因进化树中,v890和15673与AY421760.1属于不同簇,在P2基因进化树中,与v890和15673核苷酸一致性较高的是CV-A16 (83.2%和82.8%)、CV-A14 (83.0%和82.8%)和CV-A4 (82.4%和82.2%),在P3基因进化树中,与v890和15673核苷酸一致性较高的是CV-A4 (85.1%和84.8%)、CV-A14 (84.9%和84.7%)和CV-A16 (83.9%和83.2%)。