《表3 SPVG-CH2-Ch1与其它SPVG分离物基因组全序列及不同蛋白之间的核苷酸和氨基酸一致性》
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《甘薯病毒G CH株系和CH2株系中国分离物基因组全序列克隆及结构特征分析》
-:无相应氨基酸。-:No corresponding amino acid.5′UTR:5′Untranslated region;P1:the first protein;HC-Pro:helper component proteinase;P3:the third protein;PIPO:frame-shift fusion protein;6K1:the first 6K protein;CI:cytoplasmic inclusion protein;6K2:the sec
基因组全序列一致性分析结果表明,SPVG-CH-Ch1与SPVG-CH2-Ch1分离物之间的核苷酸一致性较低,为78.6%,属于不同株系。SPVG-CH-Ch1分离物与GenBank中登录的10个SPVG分离物基因组全序列的核苷酸一致性为78.6%~99.1%,与IS103分离物(KM014815)的核苷酸一致性最高,为99.1%,与WT325分离物(KF790759)的核苷酸一致性最低,为78.6%(表2)。SPVG-CH2-Ch1分离物与GenBank登录的其它10个SPVG分离物基因组全序列的核苷酸一致性为77.9%~98.6%,与WT325分离物(KF790759)的核苷酸一致性最高,为98.6%,与66Al分离物(KX279878)的核苷酸一致性最低,为77.9%(表3)。
图表编号 | XD00181424500 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.06.01 |
作者 | 秦艳红、王爽、乔奇、王永江、张德胜、张振臣 |
绘制单位 | 河南省农业科学院植物保护研究所河南省农作物病虫害防治重点实验室农业部华北南部作物有害生物综合治理重点实验室、河南省农业科学院植物保护研究所河南省农作物病虫害防治重点实验室农业部华北南部作物有害生物综合治理重点实验室、河南省农业科学院植物保护研究所河南省农作物病虫害防治重点实验室农业部华北南部作物有害生物综合治理重点实验室、河南省农业科学院植物保护研究所河南省农作物病虫害防治重点实验室农业部华北南部作物有害生物综合治理重点实验室、河南省农业科学院植物保护研究所河南省农作物病虫害防治重点实验室农业部华北南部作 |
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