《表2 CCYV山东分离物与GenBank中其它CCYV分离物全基因组RNA1链核苷酸/氨基酸序列一致性分析》

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《瓜类褪绿黄化病毒山东分离物全基因组序列扩增及分析》

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CCYV山东分离物和GenBank中已有CCYV分离物的全基因组一致性分析结果显示，CCYV山东分离物RNA1链和RNA2链的全基因组序列和其它地区分离物的一致性平均分别为99.82%和99.88%，相似性较高。CCYV山东分离物的RNA1链序列与CCYV-Beijing（JQ904628）和CCYV-TW(JN641883）分离物的RNA1链序列一致性最高（表2），RNA2链序列与CCYV-Shanghai(KY400633）和CCYV-Yilan(JN126046）分离物的RNA2链序列一致性最高（表3）。进一步将3′UTR区、5′UTR区和各编码区进行比对，RNA1链中的5′UTR、RdRp(RNA-dependent RNA polymerase）、p22和RNA2链中的Hsp70h(70 kD heat-shock protein）、p6、CP(coat protein）、CPm(minor coat protein）及p26基因的序列一致性高于全基因组序列一致性的平均值，变异程度最低。氨基酸比对分析发现，各基因编码氨基酸序列相似性均在99.36%以上，其中RNA1链中的RdRp基因以及RNA2链中的Hsp70h、p6、CP基因编码的氨基酸更为保守。