《表2 分离物YN5946-7与SLCCNV分离物及其它源自中国的同属病毒核苷酸及氨基酸序列相似性比较》
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《复合侵染水茄的两种菜豆金色花叶病毒属病毒基因组结构特征分析》
nt:核苷酸序列;aa:氨基酸序列;ND:未获得此信息;CN:中国;TH:泰国;VN:越南;MY:马来西亚;IN:印度;PH:菲律宾;ID:印度尼西亚。
因SLCCNV分离物YN5946-7与YN5947-9相似性较高,因此以分离物YN5946-7为代表进行基因组结构分析。应用MegAlign软件将SLCCNV分离物YN5946-7的DNA-A序列与GenBank中其它SLCCNV分离物的DNA-A序列进行深入比对,发现分离物YN5946-7与来自泰国的SLCCNV-Thailand分离物(AB330078)在全基因组、非编码区及各基因编码区的相似性都最高,在98.3%~100.0%之间,与来自中国的其它双组分菜豆金色花叶病毒属病毒的相似性都较低,均小于71.0%(表2)。
图表编号 | XD00181417800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.04.01 |
作者 | 赵丽玲、钟静、施章吉、李婷婷、丁铭、张仲凯 |
绘制单位 | 云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所云南省农业生物技术重点实验室农业农村部西南农业基因资源与种质创制重点实验室、云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所云南省农业生物技术重点实验室农业农村部西南农业基因资源与种质创制重点实验室、云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所云南省农业生物技术重点实验室农业农村部西南农业基因资源与种质创制重点实验室、云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所云南省农业生物技术重点实验室农业农村部西南农业基因资源与种质创制重点实验室、云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所云南省 |
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