《表2 猕猴桃褪绿环斑相关病毒分离物ZZ1、ZZ2和HN-6之间核苷酸与氨基酸序列的同源率》
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《猕猴桃褪绿环斑相关病毒在陕西省的分布、分子变异及其2个分离物的基因组序列》
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AcCRaV分离物ZZ1的RNA1~RNA5长度分别为7 049、2 266、1 691、1 736、1 460 nt,GenBank登录号分别为MN022297~MN022301;分离物ZZ2的RNA1~RNA5长度分别为7 274、2 266、1 696、1 683、1 497 nt,GenBank登录号分别为MN022302~MN022306。分离物ZZ1和ZZ2的基因组均有5个开放阅读框(open reading frame,ORF),其中RNA1的ORF编码依赖于RNA的RNA聚合酶蛋白;RNA2的ORF编码糖蛋白前体蛋白;RNA3的ORF编码核衣壳蛋白;RNA4的ORF编码1个膜蛋白;RNA5的ORF编码1个假定蛋白。2个AcCRaV周至分离物ZZ1和ZZ2与中国湖北省HN-6分离物的5条RNA核苷酸序列中,同源率最高的是分离物ZZ2与HN-6的RNA4,为96.0%,同源率最低的是分离物ZZ2与HN-6的RNA1,为87.8%;3个分离物的5个ORF编码蛋白氨基酸序列之间,同源率最高的是分离物ZZ2与HN-6的ORF4和ORF5,均为100.0%,同源率最低的是分离物ZZ1与HN-6的ORF5以及分离物ZZ1与ZZ2的ORF5,均为95.6%(表2)。
图表编号 | XD00181418000 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.04.01 |
作者 | 赵磊、吴宽、顾沛雯、曹孟籍、王乔春、吴云锋 |
绘制单位 | 西北农林科技大学植物保护学院旱区作物逆境生物学国家重点实验室农业部西北黄土高原作物有害生物综合治理重点实验室、西北农林科技大学植物保护学院旱区作物逆境生物学国家重点实验室农业部西北黄土高原作物有害生物综合治理重点实验室、杨凌职业技术学院、宁夏大学农学院、西南大学柑橘研究所、西北农林科技大学植物保护学院旱区作物逆境生物学国家重点实验室农业部西北黄土高原作物有害生物综合治理重点实验室、西北农林科技大学园艺学院、西北农林科技大学植物保护学院旱区作物逆境生物学国家重点实验室农业部西北黄土高原作物有害生物综合治理重 |
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