《表2 猕猴桃褪绿环斑相关病毒分离物ZZ1、ZZ2和HN-6之间核苷酸与氨基酸序列的同源率》

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《猕猴桃褪绿环斑相关病毒在陕西省的分布、分子变异及其2个分离物的基因组序列》


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AcCRaV分离物ZZ1的RNA1~RNA5长度分别为7 049、2 266、1 691、1 736、1 460 nt,GenBank登录号分别为MN022297~MN022301;分离物ZZ2的RNA1~RNA5长度分别为7 274、2 266、1 696、1 683、1 497 nt,GenBank登录号分别为MN022302~MN022306。分离物ZZ1和ZZ2的基因组均有5个开放阅读框(open reading frame,ORF),其中RNA1的ORF编码依赖于RNA的RNA聚合酶蛋白;RNA2的ORF编码糖蛋白前体蛋白;RNA3的ORF编码核衣壳蛋白;RNA4的ORF编码1个膜蛋白;RNA5的ORF编码1个假定蛋白。2个AcCRaV周至分离物ZZ1和ZZ2与中国湖北省HN-6分离物的5条RNA核苷酸序列中,同源率最高的是分离物ZZ2与HN-6的RNA4,为96.0%,同源率最低的是分离物ZZ2与HN-6的RNA1,为87.8%;3个分离物的5个ORF编码蛋白氨基酸序列之间,同源率最高的是分离物ZZ2与HN-6的ORF4和ORF5,均为100.0%,同源率最低的是分离物ZZ1与HN-6的ORF5以及分离物ZZ1与ZZ2的ORF5,均为95.6%(表2)。