《表3 O-Ch1、RC-Ch1与其他分离物核苷酸和氨基酸序列一致性》

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《甘薯羽状斑驳病毒O株系和RC株系中国分离物全基因组序列分析及其遗传特征》

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-：没有相应的氨基酸

利用DNAMAN软件对SPFMV-O-Ch1、SPFMV-RC-Ch1分离物以及GenBank中登录的其他48个分离物基因组序列进行比对分析（表3），结果表明SPFMV-O-Ch1与SPFMV-RC-Ch1之间的全序列核苷酸一致性较低，为87.3%，多聚蛋白的核苷酸和氨基酸一致性分别为88.2%和94.0%，属于不同的株系。SPFMV-O-Ch1与GenBank中登录的48个分离物基因组全序列核苷酸一致性为86.0%—95.8%，与乌干达的Ruk73分离物一致性最高（95.8%），与美国的11-1分离物一致性最低（86.0%）。多聚蛋白的比对结果表明，SPFMV-O-Ch1与48个分离物核苷酸一致性范围为87.0%—95.8%，与Ruk73分离物一致性最高，为95.8%，与11-1和澳大利亚Aus3-2BC分离物一致性最低，为87.0%；氨基酸一致性范围为92.1%—97.6%，与阿根廷O-Arg分离物一致性最高，为97.6%，与肯尼亚SRF109a分离物一致性最低，为92.1%。