《表2 核苷酸一致性和系统发育分析用ApNMV分离物》

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通过BLASTn检索发现29个分离物序列均为ApNMV RNA3中的CP基因序列（表2），序列全长CP基因均为660 bp。将29个株系分别命名为：ApNMV-NM1～ApNMV-NM29(Gen Bank数据库登录号MT248343～MT248371）。29个ApNMV序列间的核苷酸一致性为94.1%～99.8%，其中ApNMV-NM14与ApNMV-NM21的一致性最低，为94.1%；ApNMV-NM9与Ap NMV-NM12的一致性最高，为99.8%。GenBank数据库中存储的19个ApNMV株系CP基因核苷酸序列一致性为87.1%～99.4%；本研究的29个序列与Gen Bank数据库中存储的19个ApNMV株系的核苷酸序列一致性为86.1%～97.1%，其中ApNMV-NM21与MN529263（印度红蛇果株系）的核苷酸一致性最低，为86.1%，ApNMV-NM26与ApNMV-LC108995（日本ApNMV‘富士’苹果株系）和NC040470（日本ApNMV‘富士’苹果株系）的核苷酸一致性最高，为97.1%。基于上述Ap NMV全长CP基因核苷酸一致性数据可以看出，Ap NMV在世界范围内分子变异程度很低，不同分离物间具有较高的核苷酸一致性。