《表1 与Pa LCu GDV其他分离物核苷酸序列的一致性》

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《福建西番莲上广东番木瓜曲叶病毒的分子鉴定》


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将F1、F2样品中扩增出的DNA特异性目的片段进行回收、纯化,克隆至p MD18-T载体后筛选阳性克隆、测序。F1、F2样品测定的序列长度均为892 bp,两者序列完全一致。BLAST分析结果表明,目的片段序列与已报道的Begomovirus双生病毒高度一致,其中与西番莲寄主上已报道的Pa LCu GDV核苷酸序列一致性较高(98.9%~99.5%),以与韩国西番莲分离物JN17-PF10(Gen Bank登录号:MK070462)一致性最高为99.5%,与韩国西番莲分离物CN17-PF12(Gen Bank登录号:MK070449)一致性最低为98.9%;而与洋桔梗、一品红、烟草、番木瓜和赛山蓝等寄主上的Pa LCu GDV核苷酸序列一致性为85.5%~95.1%,其中以与菲律宾赛山蓝分离物W1(Gen Bank登录号:KF446659)一致性最低,为85.5%。